Passer au contenu

/ La recherche

Je donne

Rechercher

Sciences de la vie; Sciences naturelles et génie; Sciences sociales et humaines

Joseph Orkin

Génomique, métagénomique, protéomique

Professeur adjoint

Faculté des arts et des sciences - Département d'anthropologie

joseph.orkin@umontreal.ca

Professeur adjoint

Faculté des arts et des sciences - Département de sciences biologiques

Autre numéro : 514 343-7522 (Travail 1)

Médias

Chiens détecteurs d'excréments pour la conservation des gibbons

Portrait

Expertise de recherche

Mon laboratoire utilise des outils moléculaires - génomique, métagénomique et protéomique - pour répondre à des questions anthropologiques. 

Primatologie moléculaire

  • Adaptation des primates à des environnements changeants et hostiles
  • Génomique des populations de primates en liberté
  • Écologie microbienne intestinale des primates

Anthropologie des aliments fermentés et conservés

  • Écologie microbienne de la fermentation alimentaire
  • Interaction bioculturelle entre l'homme et les aliments qu'il produit

Développement de nouvelles méthodes d'écologie moléculaire non invasive

  • fecalFACS
  • Chiens détecteurs d'excréments

Formation

  • 2005 — B.A. — PhilosophiePenn State University
  • 2005 — B.A. — AnthropologiePenn State University
  • 2014 — PhD — AnthropologieWashington University in St. Louis

Affiliations et responsabilités

Projets

Projets de recherche

2023 - 2029

MultiOmic Primate Adaptation to Local Environments

Chercheur principal : Joseph Orkin
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(DGECR) Tremplin vers la découverte
2023 - 2029

MultiOmic Primate Adaptation to Local Environments

Chercheur principal : Joseph Orkin
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2023 - 2026

Sociocultural Foodomics of Heritage Preserved Salmon

Chercheur principal : Joseph Orkin
Co-chercheurs : Andrew Flachs
Sources de financement : CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention : PV153480-Subventions de développement Savoir
2022 - 2024

A new model system for Assessing the socio environmental determinants of the pace of aging : leverging a long term sutdy of wild capuchins_Subaward No 1000005099

Chercheur principal : Joseph Orkin
Co-chercheurs : Fernando Alonso Campos
Sources de financement : NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :

Rayonnement

Publications et communications

Publications

Orkin JD, Montague MJ, Tejada-Martinez D, de Manuel M, [18 others], Melin AD. 2021. The genomics of ecological flexibility, large brains, and long lives in capuchin monkeys revealed with fecalFACS. PNAS. 118(7): e2010632118.

Orkin JD1, Kuderna LFK1, Marques-Bonet T. 2021. The diversity of primates: from biomedicine to conservation genomics. Annual Reviews of Animal Biosciences. 9: 103-124.

Flachs A and Orkin JD. 2021. On pickles: Biological and sociocultural links between fermented foods and the human gut microbiome. Journal of Ethnobiology and Ethnomedicine. 17 (39).

Orkin JD, Campos FA, Myers MS, Cheves Hernandez SE, Guadumez A, Melin AD. 2019. Seasonality of the gut microbiota of free ranging white-faced capuchins in a tropical dry forest. The ISME Journal. 13: 183-196.

Orkin JD1, Webb SE1, Melin AD. 2019. Modest to small impact of social group on the gut microbiome of wild Costa Rican capuchins in a seasonal forest. American Journal of Primatology. e22985.

Orkin JD, Yang YM, Yang CY, Yu DW, Jiang XL. 2016. Cost-effective scat-detection dogs: unleashing a powerful new tool for international mammalian conservation biology. Scientific Reports. 6(34758): 1-10.

Orkin JD and Pontzer H. 2011. The narrow niche hypothesis: gray squirrels shed new light on primate origins. American Journal of Physical Anthropology. 144: 617-624.

Disciplines

  • Génomique
  • Anthropologie biologique
  • Biologie moléculaire

Champ d’expertise

  • Génétique des populations
  • Bioinformatique
  • Génomique du paysage
  • Primatologie
  • Génomique comparative
  • Écologie moléculaire
  • Écologie microbienne
  • Conservation de la biodiversité
  • Adaptation
  • Évolution
  • Biodiversité
  • Chine
  • Madagascar
  • Costa Rica

Aide en ligne pour votre profil | Nous joindre

Le Répertoire des professeurs est propulsé par les données du SADVR et est un projet du CENR.

Personnes-ressource dans nos équipes
Qui fait quoi?
Formulaires, procédures et systèmes
Formulaires et procédures
Occasions de financement avec PIVOT
PIVOT